可送检的样品类型与对应检测项目
| 样品类型 | 典型应用场景 | 主要检测项目 | 常用方法 / 参考 |
|---|---|---|---|
| 细菌分离株与保藏菌种 | 食源性疾病溯源、生产环境菌库建立、菌种入库复核 | 生化表型谱鉴定、药敏表型(MIC)、生长曲线、毒力因子表达、生物膜形成能力、菌种纯度与遗传稳定性 | 全自动生化鉴定卡、微量肉汤稀释(CLSI M07/M100)、比浊法生长曲线、16S rRNA 测序佐证 |
| 发酵工业菌种 | 酿酒酵母、毕赤酵母、乳酸菌与芽孢杆菌的定向改造评价、发酵工艺匹配 | 碳氮源利用谱、产物表型(酶活、有机酸、醇类)、耐受性表型(乙醇、酸、温度)、连续传代稳定性 | 底物利用微孔板、酶活分光光度法、梯度耐受培养、传代培养比较 |
| 哺乳动物细胞系 | HEK293T、CHO-K1、HeLa、HepG2 等细胞模型建立与药物筛选 | 增殖与凋亡表型、细胞周期分布、表面标志物免疫表型、报告基因活性、支原体与活力复核 | 流式细胞术、CCK-8 法、Annexin V 染色、荧光素酶报告系统 |
| 基因编辑材料 | CRISPR 编辑克隆、转基因细胞株、基因敲除菌株的效果验证与脱靶评估 | 靶点编辑效率、插入缺失谱、拷贝数变化、编辑后目标表型变化关联分析 | T7E1 酶切粗筛、Sanger 测序解谱、高通量测序、荧光定量 PCR |
| 植物突变体与转基因株系 | 拟南芥、水稻等模式植物功能基因研究、品种性状评价 | 形态与生理表型(株高、叶绿素含量、发芽率)、目标基因表达量、外源基因表达稳定性 | 表型组平台成像、叶绿素仪、实时荧光定量 PCR |
| 配对基因型与表型的生物样本 | 疾病关联研究、生物标志物筛选与靶点验证 | 基因分型与表型关联分析、表达谱差异、靶点响应表型 | 荧光定量 PCR、表达谱芯片、高通量测序 |
| 生物样本库入库与复苏样本 | 细胞、组织、菌株入库质检与复苏活力复核 | 细胞活率、支原体、STR 分型、菌种纯度、关键表型复苏前后一致性 | 台盼蓝拒染法、PCR 法支原体检测、STR 分型、GB/T 37864-2019 质量体系核查 |
检测项目
1. 生化表型谱鉴定:不少于20项生化反应(糖发酵、酶活性、同化试验),鉴定置信度不低于85%
2. 药敏表型MIC测定:可测药物21-50种,浓度范围0.002-256μg/mL,折点判读执行CLSI M100
3. 细胞免疫表型:8色及以上流式方案,稀有亚群检出下限0.01%,重复性RSD不大于10%
4. 基因表达与表型关联:荧光定量PCR扩增效率90%-110%,标准曲线R²不低于0.99,相对表达量按2-ΔΔCt法计算
5. 生长曲线表型:OD600线性范围0.05-2.0,比浊法连续监测,倍增时间拟合R²不低于0.98
6. 报告基因活性:荧光素酶检测动态范围不少于3个数量级,最低检出可达阿摩尔级
检测范围
1. 细菌菌株:大肠埃希氏菌、金黄色葡萄球菌、枯草芽孢杆菌、沙门氏菌、铜绿假单胞菌等
2. 真菌与酵母:酿酒酵母、毕赤酵母、白色念珠菌、丝状真菌等
3. 动物细胞系:HEK293T、CHO-K1、HeLa、HepG2、Vero 等
4. 基因编辑生物:CRISPR 编辑细胞克隆、转基因细胞株、基因敲除菌株与编辑植株
5. 植物材料:拟南芥突变体、水稻转基因株系、作物品种资源表型评价
检测方法
1. GB/T 37864-2019 生物样本库质量和能力通用要求
2. GB/T 43731-2024 生物样本库中生物样本处理方法的确认和验证通用要求
3. GB/T 39766-2021 人类生物样本库管理规范
4. GB 19489-2008 实验室 生物安全通用要求
5. GB/T 27025-2019 检测和校准实验室能力的通用要求
6. CLSI M07/M100 微量肉汤稀释药敏试验方法与结果判读标准(体系标准,不带年份引用)
检测设备
1. 流式细胞仪(BD FACSCanto II):488nm/633nm双激光,8荧光通道,可检测颗粒0.2-50μm
2. 全自动微生物鉴定药敏分析仪(VITEK 2 Compact):64孔测试卡,动态比浊读数,4-18小时报告
3. 实时荧光定量PCR仪(ABI 7500 Fast):96孔反应模块,温度控制4-100℃,支持梯度扩增
4. 多功能微孔板检测仪(BioTek Synergy H1):光吸收、荧光、发光三模式,波长范围200-999nm,步进1nm
5. 激光扫描共聚焦显微镜(Leica TCS SP8):405-633nm激光组,兼容37℃与5%二氧化碳活细胞培养舱
6. 全自动菌落计数与抑菌圈分析仪:500万像素成像,抑菌圈直径测量精度±0.1mm
7. 倒置荧光显微镜(Olympus IX73):4-100倍物镜,相衬与荧光观察,配活细胞平台
8. 凝胶成像系统(Bio-Rad ChemiDoc MP):紫外与蓝光透照,化学发光检测,16bit制冷CCD
9. 二级生物安全柜(A2型,1300系列):下降风速0.35-0.55m/s,流入风速约0.5m/s
10. 高速冷冻离心机:最高转速15000r/min,温控范围-10℃至40℃,最大相对离心力21000g