检测项目

1.序列完整性分析:采用Agilent2100生物分析仪检测RNA完整性数值(RIN≥7.0),片段分布范围200-6000nt

2.表达水平定量:基于RT-qPCR的绝对定量(Ct值0.5),动态范围10^1-10^8copies/μL

3.剪接变异体鉴定:IlluminaNovaSeq6000平台进行150bp双端测序,覆盖深度≥30

4.多聚腺苷酸化位点定位:PacBioSequelII系统进行全长转录本测序(准确度≥Q30)

5.融合转录本筛查:ArcherFusionPlexPanel捕获建库(灵敏度0.1%VAF)

检测范围

1.哺乳动物细胞系(HEK293、HeLa等)培养物提取的总RNA

2.临床组织样本(福尔马林固定石蜡包埋组织)的微量RNA

3.外周血单个核细胞(PBMC)分离的循环RNA

4.植物组织(拟南芥叶片)低温保存样本

5.微生物群落(土壤/肠道宏转录组)复杂样本

检测方法

ISO20184-1:2019《分子体外诊断检验-冷冻组织标本中RNA的分离纯化》

ASTME3133-18《核酸测序数据质量评估标准指南》

GB/T34796-2017《核酸定量测定用物质的量浓度标准物质》

ISO20395-2019《生物技术-核酸靶序列定量方法的验证要求》

GB/T37872-2019《高通量基因测序数据质量要求》

检测设备

ThermoFisherQuantStudio6Pro:实时荧光定量PCR系统(温度均一性0.25℃)

Agilent4200TapeStation:自动化电泳系统(灵敏度1pg/μLRNA)

IlluminaNovaSeq6000:高通量测序平台(单次运行输出6Tb数据)

NanoporeGridIONX5:长读长测序设备(读长≥4Mb)

BeckmanCoulterBiomeki7:自动化液体处理工作站(移液精度1%)

QiagenQIAcubeConnect:核酸纯化系统(最大通量12样本/批次)

SartoriusCubisIIMSA:微量天平(分辨率0.1μg)

EppendorfMastercyclerX50:梯度PCR仪(升降温速率6℃/s)

Bio-RadCFXOpus96:实时定量PCR系统(多色荧光检测通道)

CovarisM220:聚焦式超声破碎仪(DNA片段化精度50bp)