检测项目

1.琥珀包裹样本DNA完整性评估:通过Qubit4.0测定DNA浓度(0.1-1000ng/μL),片段长度分析(50-5000bp)

2.古核基因位点特异性扩增:靶向线粒体COI基因(扩增子长度100-300bp),覆盖率≥95%

3.氧化损伤定量分析:8-oxo-dG损伤位点检测(灵敏度0.01%突变频率)

4.外源污染筛查:微生物16SrRNA宏基因组比对(污染阈值≤0.5%)

5.单核苷酸多态性验证:SNP分型精度≥99.9%(MAF≥5%)

检测范围

1.中生代琥珀包裹昆虫/植物组织(年龄≤1亿年)

2.博物馆馆藏干制标本(保存年限50-300年)

3.法医陈旧性生物检材(保存条件-20℃至常温)

4.永冻层出土哺乳动物遗骸(温度≤-10℃)

5.石笋/冰芯中古环境DNA样本(沉积年代≤10万年)

检测方法

ISO20395:2019生物技术-古代DNA测序质量控制要求

GB/T34797-2017古DNA提取与纯化技术规范

ASTME3069-19古代材料中污染物分子鉴定标准指南

ISO/IEC17025:2017检测实验室通用技术要求

GB19489-2008实验室生物安全通用要求

检测设备

1.ThermoFisherIonGeneStudioS5Plus:半导体测序平台(读长200-600bp)

2.Agilent4200TapeStation:核酸完整性数值化评估(DIN值1-10)

3.CovarisM220Focused-ultrasonicator:DNA片段化控制(目标片段100-400bp)

4.RocheLightCycler480II:实时定量PCR污染监控(检出限10拷贝/μL)

5.OxfordNanoporeGridIONX5:长读长古DNA拼接(N50≥10kb)

6.BeckmanCoulterBiomeki7:自动化建库系统(通量96样本/批次)

7.IlluminaMiSeqDx:SNP验证金标准(Q30≥80%)

8.EppendorfMastercyclerX50s:梯度PCR扩增(温控精度0.1℃)

9.MalvernPanalyticalNanoSightNS300:纳米颗粒污染物分析(粒径10-2000nm)

10.HamiltonMicrolabSTARlet:微量液体处理系统(移液精度0.5%)