检测项目

1.基因组多样性分析:采用全基因组测序(覆盖深度≥50,测序平台IlluminaNovaSeq6000)
2.宿主特异性验证:测试20种标准宿主菌株(ATCC编号:6538P、25922等)的裂解效率
3.交叉感染概率测定:建立双层琼脂扩散模型(孔径0.5mm0.02mm)
4.浓度梯度定量:qPCR绝对定量(引物Tm值582℃,扩增效率90-110%)
5.抗性基因筛查:CRISPR阵列分析(分辨率1bp,使用GeneiousPrime2023.2软件)

检测范围

1.临床分离样本:痰液/血液/组织液中的噬菌体复合物
2.环境监测样本:污水/土壤/空气沉降物(粒径≤5μm)
3.食品工业原料:乳制品/肉制品发酵菌群
4.制药中间体:噬菌体制剂生产原料(效价≥10^8PFU/mL)
5.科研标准品:NISTSRM2917参考物质及其衍生品

检测方法

1.ISO21710:2020《分子生物学用噬菌体滴度测定》双层琼脂法
2.GB/T38506-2020《微生物群体基因组测序通用要求》
3.ASTME2871-19《抗菌剂效力评估中噬菌体使用标准》
4.ISO16140-3:2021《食品链微生物学-噬菌体检测验证协议》
5.GB4789.30-2016《食品安全国家标准单核细胞增生李斯特氏菌噬菌体检验》

检测设备

1.IlluminaNovaSeq6000系统:双通道S4流动槽,通量20Breads/run
2.ThermoFisherQuantStudio7Pro:支持TaqMan探针法绝对定量
3.BeckmanCoulterCytoFLEXSRT:流式细胞术检测粒径分布(3-200nm)
4.SartoriusBIOSTATB-DCUII:生物反应器(工作体积5-15L)
5.MalvernZetasizerUltra:动态光散射分析(温度控制0.1℃)
6.EppendorfCentrifuge5920R:最大转速20,000g(角转子FA-45-30-11)
7.Bio-RadChemiDocMP:化学发光成像系统(像素密度3.2MP)
8.HamiltonMICROLABSTARlet:液体处理工作站(精度0.5μL)
9.Agilent4200TapeStation:核酸完整性检测(DIN值≥7.0)
10.MemmertCO₂培养箱:温度波动度0.3℃,CO₂控制精度0.1%