组成型异染色质检测

检测项目

1.重复序列富集度分析：采用全基因组测序技术（WGS）测定卫星DNA（SatelliteDNA）含量≥85%的区域分布

2.CpG岛甲基化水平测定：通过亚硫酸氢盐测序法（BSP）检测DNA甲基化率（0-100%），分辨率达单碱基水平

3.组蛋白H3K9me3修饰定量：使用ChIP-seq技术测定组蛋白修饰密度（RPKM≥5.0为阳性阈值）

4.核小体占位率分析：MNase-seq法测定核小体定位精度20bp误差范围

5.异染色质蛋白1（HP1）结合效率：荧光共振能量转移（FRET）法测定结合亲和力Kd≤10nM

检测范围

1.哺乳动物细胞系（HEK293、HeLa等）的永久性异染色质区域

2.植物组织样本端粒相关组成型异染色质

3.临床病理切片中癌变细胞的异染色质异常聚集区域

4.模式生物（果蝇多线染色体、线虫生殖细胞）的组成型异染色质结构

5.基因编辑模型（CRISPR/Cas9修饰）的异染色质重组效应评估

检测方法

1.ISO10993-5:2009细胞遗传毒性试验中异染色质损伤评估标准

2.ASTME2148-16荧光原位杂交（FISH）技术规范

3.GB/T30988-2014DNA甲基化高通量检测方法通则

4.ISO/IEC17025:2017核小体定位分析的实验室能力要求

5.GB/T37871-2019组蛋白修饰质谱检测技术规范

检测设备

1.NikonEclipseNi-E荧光显微镜：配备DS-Ri2相机（分辨率61446144像素），支持FISH成像分析

2.IlluminaNovaSeq6000测序系统：全基因组测序通量≥20Tb/run，用于重复序列定位

3.ThermoFisherQExactiveHF-X质谱仪：质量精度<3ppm，组蛋白修饰定量分析专用设备

4.ZeissLSM980Airyscan2共聚焦显微镜：空间分辨率120nm，HP1蛋白动态追踪系统

5.Agilent4200TapeStation系统：DNA完整性检测（DIN≥7.0为合格标准）

6.BeckmanCoulterCytoFLEXS流式细胞仪：488nm/640nm双激光配置，核小体占位率批量检测

7.PerkinElmerChemiDocMP成像系统：化学发光法甲基化条带定量分析模块

8.EppendorfMastercyclerX50PCR仪：温控精度0.1℃，支持亚硫酸氢盐转化程序

9.Bio-RadCFXOpus96实时定量PCR系统：SYBRGreen法甲基化特异性扩增验证

10.LeicaEMICE高压冷冻仪：样品冷冻速率＞20,000℃/s，保持染色质天然结构

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

以上是与"组成型异染色质检测"相关的简单介绍，具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。