检测项目
1.总活菌计数：需氧菌总活菌数、厌氧菌总活菌数、总微生物活细胞数。
2.目标功能菌群定量：产丁酸盐菌群（如梭菌簇XIVa、IV）、产短链脂肪酸菌群、乳酸杆菌属、双歧杆菌属。
3.条件致病菌筛查与定量：肠球菌属、肠杆菌科细菌、金黄色葡萄球菌、艰难梭菌及其毒素基因。
4.菌群多样性评估指标：菌群组成α多样性指数、特定菌群间的比例分析（如厚壁菌门/拟杆菌门比值）。
5.孢子形成菌评估：梭菌属孢子活菌计数、芽孢杆菌属孢子活菌计数。
6.抗生素耐药性评估：广谱β-内酰胺酶阳性肠杆菌科细菌计数、万古霉素耐药肠球菌筛查。
7.病毒与噬菌体筛查：指示病毒颗粒计数、特定温和噬菌体检测。
8.真菌与酵母菌计数：念珠菌属活菌计数、总真菌活菌数。
9.菌群代谢活性间接评估：样本稀释度下的短链脂肪酸产生潜力。
10.菌液稳定性评估：冻存前后活菌存活率对比、不同保存条件下活菌衰减动力学。
11.病原体绝对定量：沙门氏菌、志贺氏菌、弯曲杆菌的绝对定量检测。
检测范围
新鲜供体粪便样本、经预处理后的菌液悬浊液、冷冻保存的粪菌样本、冻干粉剂型粪菌制剂、用于移植的胶囊内容物、模拟胃肠道环境处理的样本、移植前供体筛选样本、移植后回溯性分析样本、不同稀释浓度的制备样本、质量控制用标准菌株加标样本
检测设备
1.流式细胞仪：用于快速、高通量地对样本中的总活菌及特定荧光标记的细菌进行绝对计数；结合特异性荧光染料区分活菌与死菌。
2.实时荧光定量聚合酶链式反应仪：对样本中特定细菌的基因标记进行绝对定量分析；适用于检测含量低、难培养的目标菌群及病原体基因。
3.厌氧培养工作站：为严格厌氧菌的分离、培养与计数提供无氧环境；确保厌氧菌活性在操作过程中得以维持。
4.全自动菌落计数仪：对平板上的菌落进行快速、客观的识别与计数；减少人工计数误差，提高重复性。
5.基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪：对分离出的纯菌落进行快速、准确的菌种鉴定；是确认目标菌群身份的关键设备。
6.荧光显微镜：配合活死菌荧光染色试剂，直接观察并初步评估样本中微生物的活性与大致形态。
7.酶标仪：用于读取基于酶联免疫吸附原理的病原体毒素检测结果，或进行某些代谢产物的吸光度检测。
8.超低温冰箱：长期保存标准菌株、对照样本及待复检的样本，确保生物材料的稳定性。
9.生物安全柜：为样本的前处理、稀释涂布等操作提供无菌环境，保护操作人员及样本免受污染。
10.高速冷冻离心机：用于浓缩样本中的微生物、去除杂质及制备均匀的菌体悬液，为后续计数提供标准化样本。