可送检的样品类型与对应检测项目
| 样品类型 | 典型应用场景 | 主要检测项目 | 常用方法 / 参考 |
|---|---|---|---|
| 农作物种子（水稻、玉米、小麦、大豆、棉花） | 批次质量核查、品种登记前真实性核验、杂交种纯度验证 | 品种真实性（SSR/SNP指纹比对）、品种纯度、杂株类型判定 | GB/T 3543.5-1995、NY/T 1432-2014、NY/T 1433-2014、GB/T 20396-2006 |
| 蔬菜与花卉种子（番茄、黄瓜、辣椒、甘蓝、蝴蝶兰） | 包衣种子批次一致性确认、进口种子来源核查 | SSR指纹比对、INDEL标记鉴定、种子真实性与纯度 | GB/T 3543.5-1995，参照NY/T 1433-2014标记体系设计 |
| 林木种子与苗木（松类、杉类、栎类） | 树种鉴定、种源确认、造林用苗核验 | 形态学鉴定、SSR分子标记、内转录间隔区序列树种判定 | GB 2772-1999 林木种子检验规程 |
| 食用菌菌种（香菇、平菇、黑木耳） | 菌种场出厂核验、保藏菌种复核、投产前确认 | 内转录间隔区测序鉴定、菌丝形态观察、拮抗反应试验、酯酶同工酶电泳 | 内转录间隔区序列比对与培养性状综合判定 |
| 微生物菌种（细菌、真菌、工业菌株） | 菌株入库复核、发酵生产菌种确认、菌种库溯源 | 16S rRNA测序、内转录间隔区测序、gyrB补充鉴定、全基因组比对 | 模式菌株序列比对与分子系统发育分析 |
| 畜禽与水产遗传材料（血样、组织、羽毛） | 地方品种遗传资源核查、种群血缘确认 | 微卫星标记分型、线粒体DNA条形码（COI序列） | 物种微卫星位点组合与条形码序列比对 |
检测项目
1. 品种真实性：SSR核心引物20-40对，特征等位基因片段100-350bp，指纹吻合率≥95%判定为同一品种
2. 品种纯度：杂交种大田用种纯度判定不低于96.0%（GB 4404.1-2008），按SSR杂合位点比例逐株统计
3. SNP基因分型：位点数96-3072个，基因型检出率≥95%，适用于近似品种与自交系区分
4. 16S rRNA菌种鉴定：全长约1500bp或V3-V4区约460bp，序列相似性≥99.0%判定到种
5. 内转录间隔区真菌鉴定：目标扩增区间500-800bp，属级判定阈值≥97.0%
6. DUS三性测试：特异性、一致性、稳定性评价，不少于2个完整生育期
检测范围
1. 禾谷类种子：水稻（含三系杂交稻）、玉米单交种、小麦、高粱
2. 豆类与油料种子：大豆、花生、油菜
3. 蔬菜种子：番茄、黄瓜、辣椒、甘蓝、西瓜
4. 菌种与菌株：香菇、平菇、黑木耳、枯草芽孢杆菌、酵母菌
5. 林木种苗与花卉：马尾松、杉木、栎类、蝴蝶兰
6. 畜禽水产遗传材料：地方鸡种、生猪品种、常见淡水鱼
检测方法
1. GB/T 3543.5-1995 农作物种子检验规程 真实性和品种纯度鉴定
2. GB/T 20396-2006 三系杂交水稻及亲本 真实性和品种纯度鉴定 DNA分析方法
3. NY/T 1432-2014 玉米品种鉴定技术规程 SSR标记法
4. NY/T 1433-2014 水稻品种鉴定技术规程 SSR标记法
5. GB/T 19557.1-2004 植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南 总则
6. GB 2772-1999 林木种子检验规程
7. GB 4404.1-2008 粮食作物种子 第1部分：禾谷类（纯度判定限值）
检测设备
1. PCR扩增仪：96孔模块，温度范围4-100℃，升降温速率≥3.0℃/s
2. 毛细管电泳遗传分析仪：8-24道毛细管，片段范围50-900bp，分辨率1bp
3. 高通量测序平台：双端读长2×300bp，支持SNP大规模分型与全基因组比对
4. 凝胶成像分析系统：CCD分辨率500万像素，配备紫外、蓝光、白光光源
5. 高速冷冻离心机：最大转速15000rpm，控温4-40℃
6. 超微量分光光度计：dsDNA检测范围2-15000ng/μL
7. 恒温金属浴：控温范围室温-100℃，精度±0.2℃
8. 生化培养箱：温度范围5-60℃，波动度±0.5℃
9. 超低温保存箱：温度低至-86℃，用于标准样品DNA长期保存
10. 生物安全柜：洁净等级相当于ISO 5级，截面风速0.35-0.55m/s