可送检的样品类型与对应检测项目

样品类型 典型应用场景 主要检测项目 常用方法 / 参考
微量动物组织 肿瘤穿刺活检、脑区核团激光显微切割、胚胎局部组织表达谱研究 总RNA质量评价、低起始量转录组测序、差异表达基因筛查、GO与KEGG通路富集 核糖体RNA去除法建库，分子标签去重校正扩增偏差，样品管理参照GB/T 37864-2019
单细胞及少细胞悬液 流式分选免疫细胞亚群、早期胚胎单细胞、循环肿瘤细胞异质性研究 单细胞转录组、细胞类型注释、罕见细胞亚群识别、细胞周期与状态分析 微流控高通量单细胞捕获建库，每通道捕获3000-10000个细胞，双细胞比例控制在5%以内
FFPE石蜡切片 手术存档标本回顾性研究、微量病灶与穿刺组织表达谱检测 RNA片段化程度评价、微量文库构建、基因表达谱、融合基因转录本检出 DV200质量分级，随机引物片段化兼容建库，核酸定量性能评价参照ISO 20395:2019
外泌体与胞外囊泡 液体活检标志物筛选、细胞间通讯小RNA机制研究 小RNA长度分布、miRNA表达谱、差异miRNA筛选、靶基因预测 18-30nt小RNA专用文库构建，聚丙烯酰胺凝胶片段精准回收
微量植物组织 气孔保卫细胞、根尖分生组织、花粉等特定细胞类群转录响应研究 组织特异性表达谱、胁迫响应基因网络、长链非编码RNA注释 显微切割取样结合低起始量建库，流程管理参照GB/T 27025-2019
痕量微生物与环境样品 水体与空气滤膜核酸、低生物量宏转录组、共生体系微量菌体活性研究 宏转录组测序、活性菌群结构解析、原位基因表达水平定量 宿主核酸去除与核糖体RNA去除双流程，阴性对照与批次质控全程并行

检测项目

1. 总RNA质量评价：RIN≥7，微量样品可放宽至RIN≥6，FFPE样品以DV200大于50%为可测界限，最低起始量0.5-10ng

2. 转录组测序：每样品6-20Gb干净数据，Q30≥85%，有参考基因组样品比对率≥70%

3. 小RNA与miRNA谱：18-30nt长度分布峰值正常检出，测序 reads 定位率≥60%，含新miRNA预测与靶基因注释

4. 差异表达分析：FDR≤0.05且log2FC绝对值≥1，配套GO、KEGG通路富集与样本聚类热图

5. 单细胞转录组：每通道捕获3000-10000个细胞，单细胞中位基因数≥1000，双细胞比例小于5%

6. 转录本定量与可变剪接：FPKM与TPM双体系定量，外显子跳跃、内含子滞留等剪接事件识别

检测范围

1. 动物微量组织：穿刺活检组织、激光显微切割脑区核团、胚胎局部组织等

2. 临床微量样品：FFPE石蜡切片、胸腹水脱落细胞、细针穿刺细胞学样品等

3. 单细胞悬液：流式分选免疫细胞亚群、卵裂球与早期胚胎细胞、循环肿瘤细胞等

4. 微量植物样品：气孔保卫细胞、根尖分生组织、花粉粒、形成层切片等

5. 痕量生物与环境样品：低生物量宏转录组、水体与空气滤膜核酸、共生体系微量菌体等

检测方法

1. GB/T 37864-2019 生物样本库质量和能力通用要求

2. GB/T 27025-2019 检测和校准实验室能力的通用要求

3. GB 19489-2008 实验室 生物安全通用要求

4. ISO 20387:2018 生物技术 生物样本库 通用要求

5. ISO 20395:2019 生物技术 核酸靶序列定量方法性能评价要求，覆盖qPCR与dPCR

6. MIQE指南 实时荧光定量PCR实验发表最低信息要求，用于验证环节数据质控

检测设备

1. 高通量测序仪：读长2×150bp，单次运行数据输出Tb级，兼容低体积文库上机

2. 毛细管电泳生物分析仪：RNA完整性数字评分范围1-10，微量检测卡单孔上样1μL

3. 微量荧光计：核酸检测下限2pg/μL，取样体积1-20μL

4. 紫外分光光度计：核酸浓度范围2-15000ng/μL，比色皿与微量探头双模式

5. 自动化建库工作站：8通道与96通道移液模块，移液体积0.5-1000μL

6. 梯度PCR扩增仪：温度范围4-99℃，最大升降温速率6℃/s，温度精度±0.2℃

7. 实时荧光定量PCR系统：五通道荧光检测，动态范围10个数量级，支持低体积反应体系

8. 磁珠纯化系统：核酸回收率≥90%，片段分选精度±20bp

9. 流式细胞分选仪：四路分选，分选纯度≥98%，支持单细胞索引分选

10. 生物安全柜：A2型，下降风速0.35-0.55m/s，配合RNA酶污染控制流程